Balık unu, depolama veya teslimattan önce paketlenmelidir. Paketleme çantası genellikle polietilen dokuma çanta kullanır. Paketleme işi mekanik paketleme ve manuel paketleme olarak ikiye ayrılabilir. Manuel paketleme ekipmanı çok basittir, sadece terazi, portatif dikiş makinesi ve diğer basit araçlara ihtiyaç duyar. Ve paketleme otomasyonunun derecesi, fabrikanın üretim ve işleme kapasitesinin büyüklüğüne bağlıdır. Daha yüksek otomasyon derecesine sahip mekanik paketleme, giderek daha fazla üretici tarafından benimsenmiştir. Sistem, montaj hattı çalışması, kompakt yapı, daha az işgal alanı, doğru tartım ve ölçüm için uygundur, bu da işgücü verimliliğini artırabilir, emeği azaltabilir ve üretim maliyetinden tasarruf edebilir. Torbalı bitmiş balık unu, mühürlendikten sonra, depolama için doğrudan depoya gönderilebilir.
Otomatik paketleme sistemi esas olarak vidalı konveyör, otomatik kantitatif paketleme terazisi, tartı cihazı ve ekranlı bant konveyörü ve dikiş makinesinden oluşur. Tartım ve paketleme işlemi, doğru ölçüm etkisini elde etmek için paketleme vidalı konveyörün besleme kontrolünü gerçekleştirmek için tartım ekran kontrolörünün program kontrol işlevini kullanmaktır. Tartım işlemi tamamlandıktan sonra torbalar bantlı konveyör vasıtasıyla torba dikiş makinesine aktarılarak mühürleme işlemi tamamlanır. Kapandıktan sonra torbalarda bitmiş balık unu, depolama için doğrudan depoya gönderilebilir. Bu otomatik paketleme sistemi, hem yurt içi hem de yurt dışı pazarlarda oldukça popüler olan diğer toz malzemelerin ihtiyaçlarını da karşılayabilmektedir.